清遠高新區距廣州市48公里，距佛山市80公里，距深圳市180公里，地域與珠三角核心區緊密相鄰。

公路：廣（州）清（遠）高速、廣（州）樂（昌）高速、佛（山）清（遠）從(化)高速（在建）、汕（頭）湛（江）高速（在建）、107國道、省道253線貫通東西南北，公路網絡四通八達。

鐵路：京廣高鐵、京廣鐵路縱貫轄區，高新區距京廣高鐵清遠站約10公里。乘坐京廣高鐵到北京僅需8小時，到廣州僅需15分鐘；未來隨著廣深港高鐵（廣深段）的貫通，清遠高新區到香港僅需1個小時。

輕軌：正在建設中的廣清城際輕軌在清遠高新區設有2個站點，乘坐輕軌到廣州市區僅需25分鐘。

航空：30公里全程高速將清遠高新區與廣州白云國際機場緊密相連。

港口：距清遠高新區約10公里的清遠港，年吞吐能力120萬噸，可承載1000噸的船舶直通港澳。